Đây là việc làm hàng năm mà y tế học đường nhà trường cùng kết hợp với trạm y tế với mục đích phân loại sức khỏe ban đầu cho học sinh; phát hiện ra một số bệnh thông thường, bệnh tật học đường để có biện pháp tư vấn với gia đình và các em về chế độ dinh dưỡng, chế độ luyện tập hoặc điều trị chuyên khoa sao cho các em có một sức khỏe tốt nhất để học tập đạt hiệu quả. Các nội dung khám đó là: đo chiều cao, cân nặng, đo thị lực, huyết áp, khám răng, hô hấp và hệ vận động.... Hồ sơ quản lý sức khỏe học sinh được lập và lưu trữ đầy đủ tại nhà trường.
Buổi khám sức khỏe đã góp phần không nhỏ vào việc nâng cao nhận thức cho học sinh, giáo viên và phụ huynh về ý thức phòng chống một số bệnh tật học đường; phòng bệnh liên quan đến lối sống, vệ sinh cá nhân, vệ sinh học tập, kỹ năng sống...Sau khi hoàn chỉnh việc khám bệnh, các giáo viên chủ nhiệm lớp nắm bắt sơ bộ thông tin về sức khỏe hiện tại của từng em để có biện pháp gặp gỡ, trao đổi tới phụ huynh học sinh.